بازگشت مهاجران افغان از پاکستان با گزارش‌های متعدد از بدرفتاری نیروهای امنیتی آن کشور همراه شده است. شماری از بازگشت‌کنندگان می‌گویند پولیس و نهادهای حکومتی پاکستان با آنان برخورد غیرانسانی داشته و اموالشان را مصادره کرده‌اند. به‌گفته مهاجران، بخش بزرگی از دارایی‌های آنان از بین رفته و پولیس پاکستان کودکان ۱۰ تا ۱۷ ساله را بازداشت می‌کند، چند روز بدون اطلاع خانواده‌ها در بند نگه می‌دارد و سپس بدون سرپرست به مرز افغانستان منتقل می‌سازد. همچنین گزارش شده است که مأموران پاکستانی هنگام خروج مهاجران، در برابر اجازه عبور مبالغی میان ۲۰ تا ۸۰ هزار روپیه از آنان اخاذی می‌کنند.